MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 5676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	GGT	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016788	ACA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016788	GT	3	6	1805	1810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016788	GCC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016788	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016788	AAG	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016788	CTC	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016788	GATC	2	8	2288	2295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016788	GAG	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016788	TTC	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016788	ACA	2	6	8162	8167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016788	ATC	2	6	11730	11735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016788	GCA	2	6	11739	11744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016788	TAT	2	6	11760	11765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016788	CCA	2	6	11875	11880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016788	T	7	7	11995	12001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016788	T	6	6	12015	12020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016788	CCT	2	6	12022	12027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016788	CG	3	6	12068	12073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016788	CTT	2	6	12853	12858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016788	TAATCC	2	12	12936	12947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016788	CAGG	2	8	14693	14700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016788	TGA	2	6	14802	14807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016788	AAT	2	6	14839	14844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016788	A	8	8	14867	14874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016788	GT	3	6	14971	14976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016788	CCGG	2	8	14982	14989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016788	GCA	2	6	15126	15131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016788	TGC	2	6	15143	15148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016788	CCA	2	6	19118	19123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016788	TTTG	2	8	19240	19247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016788	CCT	2	6	19262	19267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016788	GGA	2	6	19356	19361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016788	CAA	2	6	19375	19380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016788	TGTGA	2	10	19410	19419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016788	GGT	2	6	19484	19489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016788	GGC	2	6	19557	19562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016788	GAT	2	6	19571	19576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016788	TACTGC	2	12	19577	19588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016788	ACC	2	6	19656	19661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016788	GGGGAT	2	12	20133	20144	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016788	GTT	2	6	20164	20169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016788	GTT	2	6	20175	20180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016788	T	6	6	20292	20297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016788	TG	3	6	20301	20306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016788	CCT	2	6	20317	20322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016788	GCAC	2	8	20353	20360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016788	CTT	2	6	20374	20379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016788	GAG	2	6	20403	20408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016788	GAGG	2	8	20466	20473	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016788	CGT	2	6	20484	20489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016788	CGT	2	6	20508	20513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016788	CAA	2	6	20586	20591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016788	CGT	2	6	20610	20615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016788	GAA	2	6	20690	20695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016788	GAG	2	6	20712	20717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016788	TGG	2	6	20841	20846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016788	GGA	2	6	21247	21252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016788	ACG	2	6	25417	25422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016788	CAC	2	6	25710	25715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016788	TAAC	2	8	25729	25736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016788	T	7	7	26499	26505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016788	CA	3	6	26520	26525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016788	ATAA	2	8	26532	26539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016788	CAG	2	6	26549	26554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016788	CTG	2	6	26578	26583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016788	CCA	2	6	26713	26718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016788	AGT	2	6	26776	26781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016788	TG	3	6	26805	26810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016788	TGA	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016788	TG	3	6	26838	26843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016788	GAA	2	6	26901	26906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016788	TTC	2	6	26975	26980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016788	AGT	2	6	27019	27024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016788	TGG	2	6	27052	27057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016788	AGAT	2	8	27154	27161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016788	AAG	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016788	T	7	7	27236	27242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016788	GTG	3	9	27245	27253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016788	GGT	2	6	27289	27294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016788	GGC	2	6	27380	27385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016788	AGTG	2	8	27412	27419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016788	GAAG	2	8	27502	27509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016788	AG	3	6	27508	27513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016788	ATT	2	6	31104	31109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016788	CAAC	2	8	31154	31161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016788	ACC	2	6	31188	31193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016788	ACC	2	6	31210	31215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016788	GGA	2	6	31239	31244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016788	ACC	3	9	34444	34452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016788	TAGG	2	8	34488	34495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016788	G	6	6	34548	34553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016788	GCG	2	6	34674	34679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016788	GTG	2	6	34687	34692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016788	GAA	2	6	34703	34708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016788	CGT	2	6	34749	34754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016788	GTA	2	6	34808	34813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016788	TGAT	2	8	34912	34919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016788	TCG	2	6	34928	34933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016788	GTT	2	6	35916	35921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016788	AT	3	6	35978	35983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016788	C	6	6	36042	36047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_016788	GGA	2	6	36199	36204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016788	AGA	2	6	39117	39122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016788	TAA	2	6	39211	39216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016788	GGC	2	6	39366	39371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016788	GGT	2	6	39593	39598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016788	CGG	2	6	39654	39659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016788	CGC	2	6	39716	39721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016788	GCCC	2	8	39765	39772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016788	GCC	2	6	39903	39908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016788	TTAT	2	8	39967	39974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016788	AAG	2	6	39980	39985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016788	GC	3	6	40023	40028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016788	TGT	2	6	40073	40078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016788	AC	3	6	40094	40099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016788	CCG	2	6	40216	40221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016788	GAA	2	6	40259	40264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016788	TTCA	2	8	40286	40293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016788	ATG	2	6	40307	40312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016788	CTA	2	6	40316	40321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016788	A	6	6	40321	40326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016788	A	6	6	40332	40337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016788	AGGA	2	8	40408	40415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016788	TTG	2	6	46833	46838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016788	GCC	2	6	46884	46889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016788	AGC	2	6	46895	46900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016788	GCA	2	6	46914	46919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016788	CAG	2	6	46921	46926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016788	CCT	2	6	56103	56108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016788	ACA	2	6	56133	56138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016788	TAG	2	6	56277	56282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016788	A	6	6	56292	56297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016788	CAC	2	6	56305	56310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016788	C	7	7	56384	56390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_016788	GT	3	6	56514	56519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016788	TCC	2	6	56527	56532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016788	GA	3	6	56555	56560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016788	CAT	2	6	56575	56580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016788	GCT	2	6	56957	56962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016788	TTA	2	6	57188	57193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016788	AGT	2	6	57218	57223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016788	TGC	2	6	57268	57273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016788	ACT	2	6	57298	57303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016788	A	6	6	58135	58140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016788	TGG	2	6	73121	73126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_016788	AGG	2	6	78499	78504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_016788	AGT	2	6	121541	121546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_016788	GGT	2	6	123081	123086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_016788	AACA	2	8	123109	123116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
279	NC_016788	CAT	2	6	123147	123152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_016788	CGT	2	6	123200	123205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_016788	TCT	2	6	123262	123267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_016788	TGC	2	6	124830	124835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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